İkinci seviye biyolojik güvenlik kabini biyolojik güvenlik kabini ile aynıdır. Gaz aynı zamanda dışarıdan da genellikle giriş olarak adlandırılan ikincil biyolojik güvenlik kabinine akar. Giriş, mikrobiyolojik işlemler sırasında üretilen aerosollerin kabinin ön çalışma penceresinden laboratuvara kaçmasını önler. Bununla birlikte, bunlar birincil biyogüvenlik kabinlerinden farklıdır, çünkü sadece HEPA ile filtrelenmiş (steril) havanın çalışma yüzeyi üzerinde akmasına izin verilir. Yerleşik bir fan, ön açıklıktan kabine ve ön ızgaraya hava çeker. Bu nedenle, filtre tarafından filtrelenmemiş olan hava, çalışma alanına doğrudan girmeyecek ve böylece emniyet kabininin içinde saklanan örnekleri ve aletleri dışarıdaki hava tarafından kirlenmeye karşı koruyacaktır.
İkincil biyolojik güvenlik kabininin benzersiz bir özelliği, filtrenin dikey katmanlı (yönsüz) HEPA filtreleri ile filtrelenmesi ve kabinin içinde aşağı doğru bir hava akışının oluşmasıdır. Sabit hava akışı, kabinin içinde dahili hava kaynaklı enfeksiyonlar oluşturarak kabinde saklanan örnekleri enfeksiyondan koruyabilir. Bu tür hava akışına çökme denir.
Farklı tiplerdeki ikincil biyolojik güvenlik dolapları arasındaki ana fark, egzoz gazının oranının ve yüksek basınçta havanın içinden dolaştırılan gazın oranının farklı olmasıdır. Buna ek olarak, farklı ikincil biyolojik güvenlik dolapları farklı egzoz yöntemlerine sahiptir: Bazı güvenlik dolapları doğrudan odaya hava filtrelemekte ve bazıları da tahsis edilen havalandırma kanalına veya binanın egzoz sistemine bağlı mahfazadan boşaltılmaktadır. Binanın dışında.
Yukarıda bahsedilen farklılıklara ek olarak, Tier 1 biyolojik güvenlik dolapları gibi tüm ikincil biyolojik güvenlik dolapları, operatörleri ve laboratuar ortamlarını hasara karşı koruyabilir. Ek olarak, ikincil güvenlik kabini ayrıca mikrobiyal işlemler sırasında ürün numunelerini kirlenmeye karşı korur. İkincil biyolojik güvenlik kabini biyolojik faktör işleminde bir, iki veya üç biyolojik güvenlik seviyesinde kullanılabilir.